오라클은 옥스퍼드 대학교와 협력해 글로벌 병원체 분석 시스템(GPAS)을 구축해 및 변이 코로나 바이러스 식별과 조치를 지원한다고 18일 밝혔다.
오라클 클라우드 인프라스트럭처(OCI)와 옥스포드의 확장 가능한 병원체 파이프라인 플랫폼(SP)을 결합해 개발된 GPAS는 기업 및 의료 조직이 코로나19 회복 속도를 늦추고, 높은 전염력과 잠재적으로 백신 면역을 저해할 수 있는 변이 코로나 바이러스에 효과적으로 대응하는 것을 목표로 한다.
해당 이니셔티브는 영국 웰컴 트러스트의 자금 지원을 받고 있는 웨일즈 공중 보건국, 카디프 대학교, 영국 보건국 등의 컨소시엄 연구를 바탕으로 개발됐다.
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데릭 크룩 옥스퍼드대학교 너필드 의과대학 미생물학 교수는 “세계 전역의 연구 기관과 공중 보건 기관, 의료 서비스 및 진단 기업의 공중 보건 과학자는 새롭게 제공되는 강력한 도구를 활용해 코로나19를 포함한 각종 전염병을 보다 깊이 이해하는데 도움을 받을 수 있다”며 “GPAS는 신종 바이러스뿐만 아니라 기타 공중 보건에 위협이 되는 미생물을 분류 및 분석하는 국제 표준 수립에 기여해 병원체 데이터 처리 역량을 비약적으로 강화할 수 있다”고 밝혔다.
그는 “오라클과의 협력을 기반으로 옥스퍼드가 진행중인 연구에 최첨단 기술 플랫폼을 접목해 나갈 수 있게 돼 기쁘게 생각한다”고 덧붙였다.
결핵 연구에 최초로 사용됐던 SP는 이제 SARS-CoV-2의 서열 데이터를 통합, 표준화, 분석 및 비교함으로써 해석된 게놈 서열을 생성하고, 새로운 변이체 및 관련 대상을 식별하는 용도로 쓰이고 있다. 오라클의 광범위한 신규 개발 작업을 바탕으로 데이터 처리 역량을 개선하고, 우수한 성능과 보안을 갖추게 됐다. 또 오라클 클라우드를 통해 전 세계 어디서나 언제든지 활용 가능하다.
SP 시스템은 글로벌 규모로 데이터를 취합한 후 수 분 이내로 코로나19 분석에 대한 포괄적이고 표준화된 결과를 도출하며, 이러한 결과는 안전한 환경에서 전 세계 국가와 공유된다.
존 벨 옥스퍼드 대학교 의과대학 흠정교수는 “다양한 병원체의 유전적 변이에 대한 체계적인 검토는 전 세계 공중 보건을 강화하는데 중요한 이점을 제공할 것”이라며 “무엇보다 오라클과의 파트너십 프로그램을 통해 이러한 기회를 마련하게 돼 기쁘게 생각한다”고 밝혔다.
오라클 클라우드의 광범위한 머신러닝 기능을 활용해 협력에 참가하는 세계 전역의 과학자, 연구원 및 정부 기관은 최초로 대규모의 코로나19 병원체 데이터를 처리 및 분석, 시각화하고 필요한 조치를 취할 수 있게 됐다.
관심 대상 변종 식별과 이에 따른 백신 및 치료 효과에 대한 잠재적 영향을 파악하는 것도 가능하다. 예를 들어, 시스템의 분석 대시보드를 통해 특정 균주가 다른 균주보다 더 빨리 확산하는지, 유전적 특징이 전파율 증가 및 백신 탈출에 영향을 미치는지에 대해 확인할 수 있다. 옥스퍼드 대학교는 이미 전 세계 SARS-CoV-2 시퀀스의 절반에 달하는 총 50만개 이상의 시퀀스를 처리했다.
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래리 엘리슨 오라클 회장 겸 최고기술책임자(CTO)는 “코로나19와 기타 병원체의 유전자 게놈 시퀀싱 및 검사의 수월한 진행을 위해 현재 글로벌 협력이 매우 절실한 상황”이라며 “향상된 SP 시스템을 기반으로 병원체 데이터 수집 및 분석을 위한 글로벌 표준을 확립함으로써 의학 연구진이 코로나19 뿐만 아니라 공중 보건을 해치는 여타 미생물 위협을 보다 잘 이해할 수 있도록 돕겠다”고 강조했다.
오라클은 향후 해당 서비스 대상을 모든 병원체로 확장하고, 각종 연구 기관과 공공 보건 기관 및 민간 기업의 과학자들과 협력함으로써 관련 연구를 기반으로 전 세계 전염병 대응 전략에 관한 의사 결정에 정보를 제공해나갈 방침이다. 해당 플랫폼은 전 세계 연구진과 비영리 단체에게 무료로 제공된다.